• ເຟສບຸກ
  • ລິ້ງຄ໌
  • youtube

ມັນເປັນທີ່ຮູ້ກັນດີວ່າໃນ dogma ສູນກາງ, RNA ເປັນຜູ້ໄກ່ເກ່ຍການຖ່າຍທອດລະຫວ່າງ DNA ແລະການສະແດງອອກຂອງທາດໂປຼຕີນ.ເມື່ອປຽບທຽບກັບການກວດຫາ DNA, ການກວດຫາ RNA ສາມາດສະທ້ອນເຖິງການສະແດງອອກຂອງ gene ໃນສິ່ງມີຊີວິດໄດ້ຢ່າງແນ່ນອນ.ການທົດລອງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ RNA ປະກອບມີ: qRT-PCR, RNA-Seq, ແລະການຊອກຄົ້ນຫາ gene fusion, ແລະອື່ນໆໂດຍອີງໃສ່ລັກສະນະຂອງ RNA ຕົວຂອງມັນເອງ (ວົງ້ໍາຕານ RNA ມີກຸ່ມ hydroxyl ຟຣີຫຼາຍກວ່າວົງແຫວນຂອງນໍ້າຕານຂອງ DNA), ບວກໃສ່ກັບ RNases ຈໍານວນຫລາຍໃນສະພາບແວດລ້ອມ, RNA ແມ່ນບໍ່ຄົງທີ່ແລະງ່າຍຕໍ່ການຊຸດໂຊມກວ່າ DNA.ຂີ້ເຫຍື້ອໃນ, ຂີ້ເຫຍື້ອອອກ, ຖ້າຄຸນນະພາບຂອງ RNA ບໍ່ດີ, ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ຜົນໄດ້ຮັບຂອງການທົດລອງຈະຕ້ອງບໍ່ພໍໃຈ, ສະແດງອອກໂດຍສະເພາະຂໍ້ມູນທີ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງຫຼືເຮັດຊ້ໍາໄດ້ບໍ່ດີ.ດັ່ງນັ້ນ, ຄວນເອົາໃຈໃສ່ຫຼາຍຕໍ່ການປຸງແຕ່ງ RNA, ແລະການເຊື່ອມໂຍງຂອງການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບແມ່ນມີຄວາມສໍາຄັນຫຼາຍກວ່າເກົ່າເພື່ອຮັບປະກັນຄວາມແມ່ນຍໍາແລະຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງຂໍ້ມູນການທົດລອງຕໍ່ໄປ.

ສໍາລັບການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງ RNA, ໂດຍທົ່ວໄປແລ້ວມີວິທີການນໍາໃຊ້ທົ່ວໄປດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້:

  • ເທັກໂນໂລຢີການຖ່າຍຮູບ
  • agarose gel electrophoresis
  • Agilent Bioanalyzer
  • PCR ປະລິມານ fluorescent ໃນເວລາຈິງ
  • ວິທີການຍ້ອມສີ fluorescent Qubit

01 ວິຊາສະເພາະ

RNA ໄດ້ປະສົມພັນທະບັດຄູ່ແລະມີຈຸດສູງສຸດຂອງການດູດຊຶມຢູ່ທີ່ຄວາມຍາວຂອງຄື້ນ 260nm.ອີງຕາມກົດຫມາຍຂອງ Lambert-Beer, ພວກເຮົາສາມາດຄິດໄລ່ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງ RNA ຈາກຈຸດສູງສຸດຂອງການດູດຊຶມຢູ່ທີ່ 260nm.ນອກຈາກນັ້ນ, ພວກເຮົາຍັງສາມາດຄິດໄລ່ຄວາມບໍລິສຸດຂອງ RNA ຕາມອັດຕາສ່ວນຂອງ 260nm, 280nm ແລະ 230nm ສູງສຸດການດູດຊຶມ.280nm ແລະ 230nm ແມ່ນຈຸດສູງສຸດຂອງການດູດຊຶມຂອງທາດໂປຼຕີນແລະໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍ, ຕາມລໍາດັບ.ອັດຕາສ່ວນຂອງ A260/A280 ແລະ A260/A230 ຂອງຄວາມບໍລິສຸດ RNA ທີ່ມີຄຸນວຸດທິຄວນຈະມີຫຼາຍກວ່າ 2. ຖ້າມັນໜ້ອຍກວ່າ 2, ມັນໝາຍຄວາມວ່າມີການປົນເປື້ອນທາດໂປຼຕີນ ຫຼືໂມເລກຸນນ້ອຍໆຢູ່ໃນຕົວຢ່າງ RNA ແລະຕ້ອງໄດ້ຮັບການຊໍາລະອີກຄັ້ງ.ແຫຼ່ງການປົນເປື້ອນຈະສົ່ງຜົນກະທົບຕໍ່ການທົດລອງທາງລຸ່ມ, ເຊັ່ນ: ການຍັບຍັ້ງປະສິດທິພາບການຂະຫຍາຍຂອງປະຕິກິລິຍາ PCR, ເຮັດໃຫ້ຜົນໄດ້ຮັບໃນປະລິມານທີ່ບໍ່ຖືກຕ້ອງ.ຄວາມບໍລິສຸດຂອງ RNA ມີອິດທິພົນຢ່າງຫຼວງຫຼາຍຕໍ່ຜົນໄດ້ຮັບຕໍ່ມາ, ດັ່ງນັ້ນ spectrophotometry ໂດຍທົ່ວໄປແມ່ນການເຊື່ອມໂຍງການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບທີ່ຂາດບໍ່ໄດ້ໃນຂັ້ນຕອນທໍາອິດໃນການທົດລອງອາຊິດນິວເຄຼຍ.

RNA instability, ວິທີການເຮັດ qua1

ຮູບທີ 1. ສະເພາະການດູດຊຶມ RNA/DNA Spectrum

02 Agarose gel electrophoresis

ນອກເຫນືອໄປຈາກຄວາມບໍລິສຸດ, ຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ຍັງເປັນຕົວຊີ້ວັດທີ່ສໍາຄັນສໍາລັບການຕັດສິນຄຸນນະພາບຂອງ RNA.ການເຊື່ອມໂຊມຂອງ RNA ຈະນໍາໄປສູ່ຈໍານວນຂະຫນາດໃຫຍ່ຂອງຊິ້ນສ່ວນສັ້ນໃນຕົວຢ່າງ, ດັ່ງນັ້ນຈໍານວນຂອງຊິ້ນ RNA ທີ່ສາມາດກວດພົບໄດ້ຢ່າງມີປະສິດທິພາບແລະກວມເອົາໂດຍລໍາດັບອ້າງອີງຈະຫຼຸດລົງ.ຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ສາມາດກວດສອບໄດ້ໂດຍ electrophoresis ຂອງ RNA ທັງຫມົດໃນ 1% agarose gel.ວິທີນີ້ສາມາດກຳນົດຄ່າເຈວໄດ້ດ້ວຍຕົວທ່ານເອງ, ຫຼືໃຊ້ລະບົບ E-Gel™ ທີ່ເຮັດສຳເລັດຮູບເພື່ອທົດສອບຄວາມສົມບູນ.ຫຼາຍກ່ວາ 80% ຂອງ RNA ທັງຫມົດແມ່ນ ribosomal RNA, ສ່ວນຫຼາຍແມ່ນປະກອບດ້ວຍ 28S ແລະ 18S rRNA (ໃນລະບົບ mammalian).RNA ຄຸນະພາບດີຈະສະແດງແຖບສົດໃສສອງອັນ, ເຊິ່ງແມ່ນ 28S ແລະ 18S ແຖບສົດໃສ, ຕາມລໍາດັບ, ຢູ່ 5 Kb ແລະ 2 Kb, ແລະອັດຕາສ່ວນຈະຢູ່ໃກ້ກັບ 2: 1.ຖ້າມັນຢູ່ໃນສະພາບທີ່ແຜ່ກະຈາຍ, ມັນຫມາຍຄວາມວ່າຕົວຢ່າງ RNA ອາດຈະຖືກທໍາລາຍ, ແລະແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ວິທີການທີ່ອະທິບາຍຕໍ່ມາເພື່ອທົດສອບຄຸນນະພາບຂອງ RNA ຕື່ມອີກ.

 RNA instability, ວິທີການເຮັດ qua2

ຮູບທີ 2. ການສົມທຽບການເຊື່ອມໂຊມ (ເລນ 2) ແລະ RNA intact (ເລນ 3) ກ່ຽວກັບ electrophoresis gel agarose

03 Agilent Bioanalyzer

ນອກເຫນືອຈາກວິທີການ electrophoresis gel agarose ທີ່ອະທິບາຍຂ້າງເທິງ, ເຊິ່ງສາມາດຊ່ວຍພວກເຮົາກໍານົດຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ໄດ້ງ່າຍໆແລະໄວ, ພວກເຮົາຍັງສາມາດໃຊ້ Agilent bioanalyzer ເພື່ອກໍານົດຄວາມສົມບູນຂອງ RNA.ມັນໃຊ້ການປະສົມປະສານຂອງ microfluidics, capillary electrophoresis, ແລະ fluorescence ເພື່ອປະເມີນຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງ RNA ແລະຄວາມສົມບູນ.ໂດຍການນໍາໃຊ້ສູດການຄິດໄລ່ໃນຕົວເພື່ອວິເຄາະໂປຣໄຟລ໌ຂອງຕົວຢ່າງ RNA, Agilent bioanalyzer ສາມາດຄິດໄລ່ຄ່າຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ອ້າງອິງ, ຈໍານວນຄວາມສົມບູນຂອງ RNA (ຕໍ່ໄປນີ້ເອີ້ນວ່າ RIN) [1].ມູນຄ່າຂອງ RIN ທີ່ໃຫຍ່ກວ່າ, ຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ສູງຂື້ນ (1 ແມ່ນຊຸດໂຊມທີ່ສຸດ, 10 ແມ່ນສົມບູນທີ່ສຸດ).ບາງການທົດລອງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ RNA ແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ RIN ເປັນຕົວກໍານົດການສໍາລັບການປະເມີນຄຸນນະພາບ.ການດໍາເນີນການທົດລອງທີ່ມີລໍາດັບທີ່ມີລະດັບສູງ (ຕໍ່ໄປນີ້ເອີ້ນວ່າ NGS) ເປັນຕົວຢ່າງ, ຄໍາແນະນໍາຂອງ Oncomine™ Human Immune Repertoire, ທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອກວດພົບ B cell ແລະ T cell antigen receptors ໃນ Thermo Fisher's Oncomine panel series, ແນະນໍາວ່າຕົວຢ່າງທີ່ມີຄ່າ RIN ຫຼາຍກວ່າ 4, ການວັດແທກປະສິດທິພາບເພີ່ມເຕີມ 3 (Fines ສາມາດອ່ານໄດ້).ມີຂອບເຂດທີ່ແນະນໍາທີ່ແຕກຕ່າງກັນສໍາລັບແຜງທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ແລະເລື້ອຍໆ RIN ທີ່ສູງກວ່າສາມາດນໍາເອົາຂໍ້ມູນທີ່ມີປະສິດທິພາບຫຼາຍຂຶ້ນ.

 RNA instability, ວິທີການເຮັດ qua3

ຮູບທີ 3, ໃນການທົດລອງ Oncomine™ Human Immune Repertoire, ຕົວຢ່າງທີ່ມີ RIN ຫຼາຍກວ່າ 4 ສາມາດກວດພົບການອ່ານ ແລະໂຄນ T cell ທີ່ມີປະສິດທິຜົນຫຼາຍຂຶ້ນ.【2】

ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ຄ່າ RIN ຍັງມີຂໍ້ຈໍາກັດບາງຢ່າງ.ເຖິງແມ່ນວ່າ RIN ມີຄວາມກ່ຽວຂ້ອງສູງກັບຄຸນນະພາບຂອງຂໍ້ມູນການທົດລອງ NGS, ມັນບໍ່ເຫມາະສົມສໍາລັບຕົວຢ່າງ FFPE.ຕົວຢ່າງ FFPE ໄດ້ຮັບການປິ່ນປົວດ້ວຍທາງເຄມີເປັນເວລາດົນນານ, ແລະ RNA ທີ່ສະກັດໄດ້ໂດຍທົ່ວໄປແລ້ວມີມູນຄ່າ RIN ຂ້ອນຂ້າງຕໍ່າ.ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ນີ້ບໍ່ໄດ້ຫມາຍຄວາມວ່າຂໍ້ມູນທີ່ມີປະສິດທິພາບຂອງການທົດລອງຈະຕ້ອງບໍ່ຫນ້າພໍໃຈ.ເພື່ອປະເມີນຄຸນນະພາບຂອງຕົວຢ່າງ FFPE ຢ່າງຖືກຕ້ອງ, ພວກເຮົາຈໍາເປັນຕ້ອງໃຊ້ການວັດແທກອື່ນນອກເຫນືອຈາກ RIN.ນອກເຫນືອຈາກ RIN, Agilent bioanalyzer ຍັງສາມາດຄິດໄລ່ມູນຄ່າ DV200 ເປັນຕົວກໍານົດການປະເມີນຜົນຂອງຄຸນນະພາບ RNA.DV200 ເປັນພາລາມິເຕີທີ່ຄິດໄລ່ອັດຕາສ່ວນຂອງຊິ້ນສ່ວນໃຫຍ່ກວ່າ 200 bp ໃນຕົວຢ່າງ RNA.DV200 ເປັນຕົວຊີ້ວັດທີ່ດີກວ່າຂອງຄຸນນະພາບຕົວຢ່າງ FFPE ກ່ວາ RIN.ສໍາລັບ RNA ທີ່ສະກັດໂດຍ FFPE, ມັນມີຄວາມສໍາພັນສູງຫຼາຍກັບຈໍານວນພັນທຸກໍາທີ່ສາມາດກວດພົບໄດ້ຢ່າງມີປະສິດທິພາບແລະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງພັນທຸກໍາ [3].ເຖິງແມ່ນວ່າ DV200 ສາມາດເຮັດໃຫ້ຂໍ້ບົກຜ່ອງໃນການກວດສອບຄຸນນະພາບຂອງ FFPE, ເຄື່ອງວິເຄາະຊີວະພາບ Agilent ຍັງບໍ່ສາມາດວິເຄາະບັນຫາຄຸນນະພາບໃນຕົວຢ່າງ RNA ໄດ້, ລວມທັງມີຕົວຍັບຍັ້ງໃນຕົວຢ່າງ.Inhibitors ຕົວເອງສາມາດສົ່ງຜົນກະທົບຕໍ່ປະສິດທິພາບການຂະຫຍາຍຂອງການທົດລອງລົງລຸ່ມແລະຫຼຸດຜ່ອນຈໍານວນຂໍ້ມູນທີ່ເປັນປະໂຫຍດ.ເພື່ອຮູ້ວ່າມີຕົວຍັບຍັ້ງຢູ່ໃນຕົວຢ່າງ, ພວກເຮົາສາມາດນໍາໃຊ້ວິທີການ PCR ປະລິມານ fluorescent ໃນເວລາທີ່ແທ້ຈິງທີ່ໄດ້ອະທິບາຍຕໍ່ໄປ.

04 PCR ປະລິມານ fluorescent ໃນເວລາຈິງ

ວິທີການ PCR ປະລິມານ fluorescent ໃນເວລາທີ່ແທ້ຈິງບໍ່ພຽງແຕ່ສາມາດກວດພົບ inhibitors ໃນຕົວຢ່າງ, ແຕ່ຍັງສະທ້ອນເຖິງຄຸນນະພາບຂອງ RNA ໃນຕົວຢ່າງ FFPE ໄດ້ຢ່າງຖືກຕ້ອງ.ເມື່ອປຽບທຽບກັບເຄື່ອງວິເຄາະຊີວະວິທະຍາ Agilent, ເຄື່ອງມືປະລິມານ fluorescence ໃນເວລາຈິງແມ່ນມີຄວາມນິຍົມຫຼາຍກວ່າຢູ່ໃນຫ້ອງທົດລອງຊີວະວິທະຍາໃຫຍ່ເນື່ອງຈາກການນໍາໃຊ້ທີ່ກວ້າງຂວາງ.ເພື່ອທົດສອບຄຸນນະພາບຂອງຕົວຢ່າງ RNA, ພວກເຮົາພຽງແຕ່ຕ້ອງການຊື້ຫຼືກະກຽມ probes primer ສໍາລັບ genes ອ້າງອີງພາຍໃນ, ເຊັ່ນ GSB (Cat no. Hs00939627).ໂດຍການນໍາໃຊ້ຊຸດຂອງ primers, probes ແລະມາດຕະຖານ (RNA ທັງຫມົດຂອງຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນທີ່ຮູ້ຈັກ) ເພື່ອດໍາເນີນການທົດລອງປະລິມານຢ່າງແທ້ຈິງ, ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງຊິ້ນ RNA ທີ່ມີປະສິດທິພາບສາມາດຖືກຄິດໄລ່ເປັນມາດຕະຖານການປະເມີນຜົນຂອງຄຸນນະພາບ RNA (Functional RNA Quantitation (FRQ) ສໍາລັບສັ້ນ).ໃນການທົດສອບ NGS, ພວກເຮົາພົບວ່າ FRQ ຂອງຕົວຢ່າງ RNA ມີຄວາມສໍາພັນສູງຫຼາຍກັບປະລິມານຂໍ້ມູນທີ່ມີປະສິດທິພາບ.ສໍາລັບທຸກຕົວຢ່າງທີ່ສູງກວ່າ 0.2ng/uL FRQ, ຢ່າງຫນ້ອຍ 70% ຂອງການອ່ານສາມາດກວມເອົາລໍາດັບການອ້າງອິງໄດ້ຢ່າງມີປະສິດທິພາບ (ຮູບ 4).

 RNA instability, ວິທີການເຮັດ qua4

ຮູບທີ 4, ຄ່າ FRQ ທີ່ກວດພົບໂດຍວິທີປະລິມານ fluorescence ມີຄວາມກ່ຽວຂ້ອງກັນສູງຫຼາຍ (R2>0.9) ກັບຂໍ້ມູນປະສິດທິພາບທີ່ໄດ້ຮັບໃນການທົດລອງ NGS.ເສັ້ນສີແດງແມ່ນຄ່າ FRQ ເທົ່າກັບ 0.2 ng/uL (log10 = -0.7).【4】

ນອກເຫນືອຈາກການສາມາດນໍາໃຊ້ກັບຕົວຢ່າງ FFPE, ວິທີການ PCR ທາງດ້ານປະລິມານໃນເວລາທີ່ແທ້ຈິງຍັງສາມາດຕິດຕາມກວດກາ inhibitors ໃນຕົວຢ່າງໄດ້ຢ່າງມີປະສິດທິພາບ.ພວກເຮົາສາມາດເພີ່ມຕົວຢ່າງທີ່ຈະກວດພົບເຂົ້າໄປໃນລະບົບຕິກິຣິຍາກັບ Internal Positive Control (IPC) ແລະ Assay ຂອງມັນ, ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນປະຕິບັດການວັດແທກປະລິມານ fluorescence ເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຄ່າ Ct.ຖ້າຄ່າ Ct ຊ້າຢູ່ຫລັງຄ່າ Ct ໃນປະຕິກິລິຍາທີ່ບໍ່ມີຕົວຢ່າງ, ມັນຊີ້ໃຫ້ເຫັນວ່າຕົວຍັບຍັ້ງມີຢູ່ໃນຕົວຢ່າງແລະຍັບຍັ້ງປະສິດທິພາບການຂະຫຍາຍໃນປະຕິກິລິຍາ.

 

05 ວິທີການຍ້ອມສີ fluorescent Qubit

Qubit Fluorometer ແມ່ນອຸປະກອນຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ໃຊ້ທົ່ວໄປທີ່ສຸດສໍາລັບຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງອາຊິດນິວເຄຼຍແລະການກວດສອບຄວາມບໍລິສຸດ, ເຊິ່ງງ່າຍຕໍ່ການປະຕິບັດແລະມີຢູ່ໃນເກືອບທຸກຫ້ອງທົດລອງຊີວະສາດໂມເລກຸນ.ມັນຄິດໄລ່ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງອາຊິດນິວຄລີອິກຢ່າງຖືກຕ້ອງໂດຍການກວດສອບແລະສີຍ້ອມ fluorescent ທີ່ຜູກມັດອາຊິດນິວຄລີອິກ (Qubit detection reagent).Qubit ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງແລະຄວາມສະເພາະ, ແລະສາມາດກໍານົດປະລິມານ RNA ລົງໄປຫາ pg/µL ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຢ່າງຖືກຕ້ອງ.ນອກເໜືອໄປຈາກຄວາມສາມາດທີ່ຮູ້ຈັກກັນດີໃນການປະເມີນຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງອາຊິດນິວຄລີອິກຢ່າງຖືກຕ້ອງ, ຮູບແບບໃໝ່ຫຼ້າສຸດຂອງ Thermo Fisher, Qubit 4.0, ຍັງສາມາດກວດຫາຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ໄດ້.ລະບົບການກວດຫາ RNA ຂອງ Qubit 4.0′s (RNA IQ Assay) ກວດພົບຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ໂດຍການກວດສອບສອງສີຍ້ອມ fluorescent ສະເພາະພ້ອມໆກັນ.ສອງສີຍ້ອມ fluorescent ເຫຼົ່ານີ້ສາມາດຜູກມັດກັບຊິ້ນຂະຫນາດໃຫຍ່ແລະຊິ້ນຂະຫນາດນ້ອຍຂອງ RNA, ຕາມລໍາດັບ.ສອງສີຍ້ອມ fluorescent ເຫຼົ່ານີ້ຊີ້ໃຫ້ເຫັນອັດຕາສ່ວນຂອງຊິ້ນໃຫຍ່ຂອງ RNA ໃນຕົວຢ່າງ, ແລະຈາກນີ້, ມູນຄ່າ IQ (ຄວາມສົມບູນແລະຄຸນນະພາບ) ທີ່ເປັນຕົວແທນຂອງຄຸນນະພາບ RNA ສາມາດຄິດໄລ່ໄດ້.ຄ່າ IQ ແມ່ນໃຊ້ໄດ້ກັບທັງຕົວຢ່າງ FFPE ແລະທີ່ບໍ່ແມ່ນ FFPE, ແລະມີອິດທິພົນອັນໃຫຍ່ຫຼວງຕໍ່ຄຸນນະພາບການຈັດລໍາດັບຕໍ່ມາ.ເອົາການທົດລອງ NGS ເປັນຕົວຢ່າງ, ໃນການທົດລອງ RNA-Seq ທີ່ດໍາເນີນຢູ່ໃນເວທີ Ion torrent™, ຕົວຢ່າງສ່ວນໃຫຍ່ທີ່ມີຄ່າ IQ ສູງກວ່າ 4 ມີການອ່ານຢ່າງນ້ອຍ 50% (ຮູບ 5).ເມື່ອປຽບທຽບກັບວິທີການກວດພົບຂ້າງເທິງ, Qubit IQ Assay ບໍ່ພຽງແຕ່ສະດວກກວ່າໃນການດໍາເນີນງານແລະໃຊ້ເວລາຫນ້ອຍ (ພາຍໃນຫ້ານາທີ), ແຕ່ຍັງມີຄວາມກ່ຽວຂ້ອງກັນຢ່າງຫຼວງຫຼາຍລະຫວ່າງຄ່າ IQ ພາລາມິເຕີທີ່ວັດແທກແລະຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນຂອງການທົດລອງລົງລຸ່ມ.

 

ຮູບທີ 5, ມີຄວາມສໍາພັນອັນໃຫຍ່ຫຼວງລະຫວ່າງຄ່າ Qubit RNA IQ ແລະການອ່ານແຜນທີ່ຂອງ RNA-Seq.【5】

ໂດຍຜ່ານການແນະນໍາຂ້າງເທິງ, ຂ້າພະເຈົ້າເຊື່ອວ່າທຸກຄົນມີຄວາມເຂົ້າໃຈພຽງພໍກ່ຽວກັບວິທີການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ RNA ທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.ໃນການປະຕິບັດ, ທ່ານສາມາດເລືອກRNA instability, ວິທີການເຮັດ qua5ວິທີການທີ່ສອດຄ້ອງກັນຕາມປະເພດຕົວຢ່າງແລະເຄື່ອງມືທີ່ມີຢູ່.ພຽງແຕ່ໂດຍການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງ RNA ໄດ້ດີພວກເຮົາສາມາດຫຼີກເວັ້ນຄວາມລົ້ມເຫຼວຂອງການທົດລອງຕໍ່ມາທີ່ເກີດຈາກຄຸນນະພາບຕົວຢ່າງທີ່ບໍ່ດີ, ດັ່ງນັ້ນປະຫຍັດເວລາ, ພະລັງງານແລະຄ່າໃຊ້ຈ່າຍທີ່ມີຄ່າ.

 

ຜະລິດຕະພັນອ້າງອີງ:

ຊຸດການແຍກ RNA ທັງໝົດຂອງສັດ

ຊຸດການແຍກ RNA ທັງໝົດຂອງເຊລ

ອ້າງອີງ

【1】 Schroeder, A., Mueller, O., Stocker, S. et al.RIN: ຕົວເລກຄວາມສົມບູນຂອງ RNA ສໍາລັບການກໍານົດຄ່າຄວາມສົມບູນໃຫ້ກັບການວັດແທກ RNA.BMC Molecular Biol 7, 3 (2006).https:// doi .org/10.1186/1471-21 99-7-3

【2】Oncomine Human Immune Repertoire User Guide (Pub. No. MAN0017438 Rev. C.0).

【3】 Leah C Wehmas, Charles E Wood, Brian N Chorley, Carole L Yauk, Gail M Nelson, Susan D Hester, ຕົວຊີ້ວັດຄຸນນະພາບທີ່ປັບປຸງສໍາລັບການປະເມີນ RNA ທີ່ມາຈາກ Archival Formalin-Fixed Paraffin-embedded Tissues, ວິທະຍາສາດດ້ານພິດວິທະຍາ, ສະບັບທີ 20 ສິງຫາ, ສະບັບທີ 20, 7 ສະບັບວັນທີ 30 ສິງຫາ, ສະບັບທີ 25, ສະບັບທີ 30 ສິງຫາ 2017, ສະບັບທີ 25, ສະບັບທີ 30 ສິງຫາ 2017 3,https://doi.org/10.1093/toxsci/


ເວລາປະກາດ: 12-06-2023