ຫຼັງຈາກນັກວິຊາການອາເມລິກາ Eric S. Lander ສະເຫນີຢ່າງເປັນທາງການເປັນ polymorphism nucleotide ດຽວ (SNP) ເປັນເຄື່ອງຫມາຍໂມເລກຸນຮຸ່ນທີສາມໃນປີ 1996, SNP ໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນການວິເຄາະລັກສະນະທາງເສດຖະກິດ, ການສ້າງແຜນທີ່ການເຊື່ອມໂຍງທາງພັນທຸກໍາທາງຊີວະພາບ, ແລະການກວດສອບເຊື້ອພະຍາດຂອງມະນຸດ., ການວິນິດໄສແລະການຄາດຄະເນຄວາມສ່ຽງຂອງພະຍາດ, ການກວດສອບຢາສ່ວນບຸກຄົນ, ແລະຂົງເຂດການຄົ້ນຄວ້າທາງດ້ານຊີວະສາດແລະການແພດອື່ນໆ.ໃນຂົງເຂດການປູກພືດເປັນເງິນສົດ, ການຊອກຄົ້ນຫາ SNP ສາມາດຮັບຮູ້ເຖິງການຄັດເລືອກເບື້ອງຕົ້ນຂອງລັກສະນະທີ່ຕ້ອງການ.ການຄັດເລືອກນີ້ມີລັກສະນະຂອງຄວາມຖືກຕ້ອງສູງແລະປະສິດທິຜົນສາມາດຫຼີກເວັ້ນການແຊກແຊງຂອງ morphology ແລະປັດໃຈສິ່ງແວດລ້ອມ, ຊຶ່ງເຮັດໃຫ້ຂະບວນການປັບປຸງພັນສັ້ນລົງຢ່າງຫຼວງຫຼາຍ.ດັ່ງນັ້ນ, SNP ມີບົດບາດອັນໃຫຍ່ຫຼວງໃນຂົງເຂດການຄົ້ນຄວ້າພື້ນຖານ.
Single Nucleotide Polymorphism (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) ຫມາຍເຖິງປະກົດການທີ່ມີຄວາມແຕກຕ່າງ nucleotide ດຽວໃນຕໍາແຫນ່ງດຽວກັນໃນລໍາດັບ DNA ຂອງບຸກຄົນຂອງຊະນິດດຽວກັນຫຼືທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.ການແຊກ, ການລຶບ, ການແປງແລະການປີ້ນກັບຖານດຽວສາມາດເຮັດໃຫ້ເກີດຄວາມແຕກຕ່າງນີ້.ໃນອະດີດ, ຄໍານິຍາມຂອງ SNP ແມ່ນແຕກຕ່າງຈາກການກາຍພັນ.ສະຖານທີ່ variant ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ຄວາມຖີ່ຂອງຫນຶ່ງຂອງ alleles ໃນປະຊາກອນແມ່ນຫຼາຍກ່ວາ 1% ເພື່ອກໍານົດເປັນສະຖານທີ່ SNP.ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ດ້ວຍການຂະຫຍາຍທິດສະດີຊີວະພາບທີ່ທັນສະໄຫມແລະການນໍາໃຊ້ເຕັກໂນໂລຢີ, ຄວາມຖີ່ຂອງ allele ບໍ່ແມ່ນເງື່ອນໄຂທີ່ຈໍາເປັນທີ່ຈະຈໍາກັດຄໍານິຍາມຂອງ SNP.ອີງຕາມຂໍ້ມູນການປ່ຽນແປງ nucleotide ດຽວລວມຢູ່ໃນຖານຂໍ້ມູນ Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) ພາຍໃຕ້ສູນຂໍ້ມູນເຕັກໂນໂລຢີຊີວະພາບແຫ່ງຊາດ (NCBI), ການໃສ່ / ລຶບຄວາມຖີ່ຕ່ໍາ, ການປ່ຽນແປງຂອງ microsatellite, ແລະອື່ນໆ.
ໃນຮ່າງກາຍຂອງມະນຸດ, ຄວາມຖີ່ຂອງ SNP ແມ່ນ 0.1%.ໃນຄໍາສັບຕ່າງໆອື່ນໆ, ມີເວັບໄຊທ໌ SNP ໂດຍສະເລ່ຍຕໍ່ 1000 ຄູ່ຖານ.ເຖິງແມ່ນວ່າຄວາມຖີ່ຂອງການປະກົດຕົວແມ່ນຂ້ອນຂ້າງສູງ, ບໍ່ແມ່ນສະຖານທີ່ SNP ທັງຫມົດສາມາດເປັນເຄື່ອງຫມາຍຂອງຜູ້ສະຫມັກທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບລັກສະນະຕ່າງໆ.ນີ້ສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງກັບສະຖານທີ່ທີ່ SNP ເກີດຂື້ນ.
ທາງທິດສະດີ, SNP ສາມາດເກີດຂຶ້ນໄດ້ທຸກບ່ອນໃນລໍາດັບ genome.SNPs ທີ່ເກີດຂຶ້ນໃນພາກພື້ນລະຫັດສາມາດຜະລິດການກາຍພັນທີ່ຄ້າຍຄືແລະການກາຍພັນທີ່ບໍ່ຄ້າຍຄືກັນ, ນັ້ນແມ່ນ, ອາຊິດ amino ປ່ຽນແປງຫຼືບໍ່ປ່ຽນແປງກ່ອນແລະຫຼັງຈາກການກາຍພັນ.ອາຊິດ amino ທີ່ປ່ຽນແປງໂດຍປົກກະຕິເຮັດໃຫ້ຕ່ອງໂສ້ peptide ສູນເສຍການທໍາງານຕົ້ນສະບັບຂອງມັນ (ການກາຍພັນທີ່ຜິດພາດ), ແລະອາດຈະເຮັດໃຫ້ເກີດການຍົກເລີກການແປພາສາ (ການກາຍພັນທີ່ບໍ່ມີເຫດຜົນ).SNPs ທີ່ເກີດຂຶ້ນໃນພາກພື້ນທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດແລະພາກພື້ນ intergenic ອາດຈະມີຜົນກະທົບ mRNA splicing, ອົງປະກອບລໍາດັບ RNA ທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດ, ແລະປະສິດທິພາບຜູກມັດຂອງປັດໄຈການຖອດຂໍ້ຄວາມແລະ DNA.ການພົວພັນສະເພາະແມ່ນສະແດງຢູ່ໃນຮູບ:
ປະເພດ SNP:
ວິທີການພິມ SNP ທົ່ວໄປຫຼາຍອັນແລະການປຽບທຽບຂອງພວກເຂົາ
ອີງຕາມຫຼັກການທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ວິທີການກວດຫາ SNP ທົ່ວໄປແມ່ນແບ່ງອອກເປັນປະເພດດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້:
ການຈັດປະເພດການປຽບທຽບວິທີການກວດຫາ
ຫມາຍເຫດ: ລາຍຊື່ຢູ່ໃນຕາຕະລາງປະຈຸບັນຖືກນໍາໃຊ້ວິທີການກວດຫາ SNP ທົ່ວໄປຫຼາຍ, ວິທີການກວດຫາອື່ນໆເຊັ່ນ: ການປະສົມສະຖານທີ່ສະເພາະ (ASH), ການຂະຫຍາຍສະຖານທີ່ primer ສະເພາະ (ASPE), ການຂະຫຍາຍພື້ນຖານດຽວ (SBCE), ການຕັດສະຖານທີ່ສະເພາະ (ASC), ເຕັກໂນໂລຊີຊິບ gene, ເຕັກໂນໂລຊີ spectrometry, ແລະອື່ນໆ.
ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍແລະເວລາຂອງການຊໍາລະອາຊິດ nucleic ໃນຫຼາຍວິທີການກວດສອບ SNP ທົ່ວໄປຂ້າງເທິງແມ່ນຫຼີກເວັ້ນບໍ່ໄດ້.ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ຊຸດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງໂດຍອີງໃສ່ເທກໂນໂລຍີ PCR ໂດຍກົງຂອງ Foregene ສາມາດປະຕິບັດການຂະຫຍາຍ PCR ຫຼື qPCR ໂດຍກົງໃນຕົວຢ່າງທີ່ບໍ່ສະອາດ, ເຊິ່ງນໍາເອົາຄວາມສະດວກສະບາຍທີ່ບໍ່ເຄີຍມີມາກ່ອນໃນການກວດສອບ SNP.
ຜະລິດຕະພັນຊຸດ PCR ໂດຍກົງຂອງ Foregene ພຽງແຕ່ແລະປະມານການຍົກເວັ້ນຂັ້ນຕອນການເຮັດຄວາມສະອາດຕົວຢ່າງ, ເຊິ່ງຊ່ວຍຫຼຸດຜ່ອນເວລາແລະຄ່າໃຊ້ຈ່າຍໃນການກະກຽມແມ່ແບບ.ເປັນເອກະລັກຂອງ Taq polymerase ມີຄວາມສາມາດຂະຫຍາຍພັນທີ່ດີເລີດແລະສາມາດທົນທານຕໍ່ຄວາມຫລາກຫລາຍຂອງ inhibitors ຈາກສະພາບແວດລ້ອມການຂະຫຍາຍທີ່ສັບສົນ.ຄຸນລັກສະນະເຫຼົ່ານີ້ສະຫນອງການຮັບປະກັນດ້ານເຕັກນິກສໍາລັບການໄດ້ຮັບຜະລິດຕະພັນສະເພາະທີ່ມີຜົນຜະລິດສູງ. Foregene Direct PCR/qPCR kits ສໍາລັບຊະນິດຕົວຢ່າງຕ່າງໆ, ເຊັ່ນ: ເນື້ອເຍື່ອສັດ (ຫາງຫນູ, zebrafish, ແລະອື່ນໆ), ໃບພືດ, ແກ່ນ (ລວມທັງ polysaccharides ແລະຕົວຢ່າງ polyphenol), ແລະອື່ນໆ.
ເວລາປະກາດ: 23-07-2021