ສາມຕົວອັກສອນ SNP ແມ່ນຢູ່ທົ່ວທຸກແຫ່ງໃນການສຶກສາພັນທຸກໍາຂອງປະຊາກອນ.ໂດຍບໍ່ສົນເລື່ອງຂອງການຄົ້ນຄວ້າພະຍາດຂອງມະນຸດ, ການຈັດຕໍາແຫນ່ງລັກສະນະພືດ, ການວິວັດທະນາການຂອງສັດແລະລະບົບນິເວດໂມເລກຸນ, SNPs ແມ່ນມີຄວາມຈໍາເປັນເປັນພື້ນຖານ.ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ຖ້າທ່ານບໍ່ມີຄວາມເຂົ້າໃຈຢ່າງເລິກເຊິ່ງກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາທີ່ທັນສະໄຫມໂດຍອີງໃສ່ການຈັດລໍາດັບທີ່ມີຄວາມໄວສູງ, ແລະປະເຊີນຫນ້າກັບສາມຕົວອັກສອນນີ້, ມັນເບິ່ງຄືວ່າ "ຄົນແປກຫນ້າທີ່ຄຸ້ນເຄີຍທີ່ສຸດ", ຫຼັງຈາກນັ້ນທ່ານບໍ່ສາມາດດໍາເນີນການຄົ້ນຄ້ວາຕໍ່ໄປ.ດັ່ງນັ້ນກ່ອນທີ່ຈະເລີ່ມຕົ້ນການຄົ້ນຄວ້າຕິດຕາມ, ໃຫ້ພວກເຮົາເບິ່ງວ່າ SNP ແມ່ນຫຍັງ.

SNP (single nucleotide polymorphism), ພວກເຮົາສາມາດເຫັນໄດ້ຈາກຊື່ພາສາອັງກິດເຕັມຂອງມັນ, ມັນຫມາຍເຖິງການປ່ຽນແປງ nucleotide ດຽວຫຼື polymorphism.ມັນຍັງມີຊື່ແຍກຕ່າງຫາກ, ເອີ້ນວ່າ SNV (ການປ່ຽນແປງ nucleotide ດຽວ).ໃນບາງການສຶກສາຂອງມະນຸດ, ພຽງແຕ່ຜູ້ທີ່ມີຄວາມຖີ່ຂອງປະຊາກອນສູງກວ່າ 1% ເອີ້ນວ່າ SNPs, ແຕ່ເວົ້າຢ່າງກວ້າງຂວາງ, ທັງສອງສາມາດປະສົມກັນໄດ້.ດັ່ງນັ້ນພວກເຮົາສາມາດເວົ້າໄດ້ວ່າ SNP, polymorphism nucleotide ດຽວ, ຫມາຍເຖິງການກາຍພັນທີ່ nucleotide ຫນຶ່ງໃນ genome ຖືກແທນທີ່ດ້ວຍ nucleotide ອື່ນ.ຕົວຢ່າງ, ໃນຮູບຂ້າງລຸ່ມນີ້, ຄູ່ຖານ AT ຖືກແທນທີ່ດ້ວຍຄູ່ຖານ GC, ເຊິ່ງເປັນເວັບໄຊທ໌ SNP.

ຮູບ

ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ບໍ່ວ່າຈະເປັນ "ການແຜ່ກະຈາຍ nucleotide ດ່ຽວ" ຫຼື "ການປ່ຽນແປງຂອງ nucleotide ດຽວ", ມັນແມ່ນຂ້ອນຂ້າງເວົ້າ, ດັ່ງນັ້ນຂໍ້ມູນ SNP ຕ້ອງການ genome resequencing ເປັນພື້ນຖານ, ນັ້ນແມ່ນ, ຂໍ້ມູນລໍາດັບແມ່ນລໍາດັບຫຼັງຈາກ genome ຂອງບຸກຄົນຖືກຈັດລໍາດັບ.ເມື່ອປຽບທຽບກັບ genome, ເວັບໄຊທ໌ທີ່ແຕກຕ່າງຈາກ genome ໄດ້ຖືກກວດພົບວ່າເປັນເວັບໄຊທ໌ SNP.

ໃນແງ່ຂອງ SNPs ກ່ຽວກັບຜັກ,ຊຸດ Plant Direct PCRສາມາດໃຊ້ສໍາລັບການຊອກຄົ້ນຫາໄວ.

ໃນແງ່ຂອງປະເພດຂອງການກາຍພັນ, SNP ປະກອບມີການຫັນປ່ຽນແລະການຫັນປ່ຽນ.ການຫັນປ່ຽນຫມາຍເຖິງການທົດແທນ purines ດ້ວຍ purines ຫຼື pyrimidines ກັບ pyrimidines.Transversion ຫມາຍເຖິງການທົດແທນເຊິ່ງກັນແລະກັນລະຫວ່າງ purines ແລະ pyrimidines.ຄວາມຖີ່ຂອງການປະກົດຕົວຈະແຕກຕ່າງກັນ, ແລະຄວາມເປັນໄປໄດ້ຂອງການຫັນປ່ຽນຈະສູງກວ່າການຫັນປ່ຽນ.

ໃນແງ່ຂອງບ່ອນທີ່ SNP ເກີດຂື້ນ, SNPs ທີ່ແຕກຕ່າງກັນຈະມີຜົນກະທົບທີ່ແຕກຕ່າງກັນຕໍ່ genome.SNPs ທີ່ເກີດຂຶ້ນໃນພາກພື້ນ intergenic, ນັ້ນແມ່ນ, ພາກພື້ນລະຫວ່າງ genes ກ່ຽວກັບ genome, ອາດຈະບໍ່ມີຜົນກະທົບການເຮັດວຽກຂອງ genome, ແລະການກາຍພັນໃນ intron ຫຼືພາກພື້ນສົ່ງເສີມຂອງ gene ອາດຈະມີຜົນກະທົບສະເພາະໃດຫນຶ່ງກ່ຽວກັບ gene ໄດ້;ການກາຍພັນທີ່ເກີດຂື້ນໃນພາກພື້ນ exon ຂອງ gene, ຂຶ້ນກັບວ່າພວກມັນເຮັດໃຫ້ເກີດການປ່ຽນແປງຂອງອາຊິດ amino ທີ່ເຂົ້າລະຫັດ, ມີຜົນກະທົບທີ່ແຕກຕ່າງກັນຕໍ່ຫນ້າທີ່ຂອງ gene.(ແນ່ນອນ, ເຖິງແມ່ນວ່າສອງ SNPs ເຮັດໃຫ້ເກີດຄວາມແຕກຕ່າງຂອງອາຊິດ amino, ພວກມັນມີຜົນກະທົບທີ່ແຕກຕ່າງກັນກ່ຽວກັບໂຄງສ້າງຂອງທາດໂປຼຕີນ, ແລະໃນທີ່ສຸດຜົນກະທົບຂອງ phenotype ຊີວະສາດອາດຈະແຕກຕ່າງກັນ).

ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ຈໍານວນຂອງ SNPs ທີ່ເກີດຂຶ້ນຢູ່ສະຖານທີ່ gene ປົກກະຕິແລ້ວແມ່ນຫນ້ອຍກ່ວາສະຖານທີ່ທີ່ບໍ່ແມ່ນ gene, ເນື່ອງຈາກວ່າ SNP ທີ່ມີຜົນກະທົບການເຮັດວຽກຂອງ gene ປົກກະຕິແລ້ວມີຜົນກະທົບທາງລົບຕໍ່ການຢູ່ລອດຂອງບຸກຄົນ, ສົ່ງຜົນໃຫ້ບຸກຄົນທີ່ປະຕິບັດ SNP ນີ້ຢູ່ໃນກຸ່ມຂອງເຂົາເຈົ້າໄດ້ຖືກລົບລ້າງ.

ແນ່ນອນ, ສໍາລັບສິ່ງມີຊີວິດ diploid, ໂຄໂມໂຊມມີຢູ່ໃນຄູ່, ແຕ່ມັນເປັນໄປບໍ່ໄດ້ທີ່ໂຄໂມໂຊມຄູ່ຈະຄືກັນສໍາລັບທຸກໆພື້ນຖານ.ດັ່ງນັ້ນ, ບາງ SNPs ຍັງຈະປາກົດເປັນ heterozygous, ນັ້ນແມ່ນ, ມີສອງຖານຢູ່ໃນຕໍາແຫນ່ງນີ້ຢູ່ໃນໂຄໂມໂຊມ.ໃນກຸ່ມ, genotypes SNP ຂອງບຸກຄົນທີ່ແຕກຕ່າງກັນໄດ້ຖືກລວມເຂົ້າກັນ, ເຊິ່ງກາຍເປັນພື້ນຖານສໍາລັບການວິເຄາະຕໍ່ໄປຫຼາຍທີ່ສຸດ.ປະສົມປະສານກັບລັກສະນະຕ່າງໆ, ມັນສາມາດຖືກຕັດສິນວ່າ SNP ເປັນເຄື່ອງຫມາຍໂມເລກຸນຖືກເຊື່ອມໂຍງກັບລັກສະນະ, QTL (locus trait quantitative) ຂອງ trait ສາມາດຖືກຕັດສິນ, ແລະ GWAS (ການສຶກສາສະມາຄົມທົ່ວ genome) ຫຼືການສ້າງແຜນທີ່ທາງພັນທຸກໍາສາມາດປະຕິບັດໄດ້;SNP ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເປັນເຄື່ອງຫມາຍໂມເລກຸນຕັດສິນຄວາມສໍາພັນ evolutionary ລະຫວ່າງບຸກຄົນ;ທ່ານສາມາດກວດສອບ SNPs ທີ່ເປັນປະໂຫຍດແລະສຶກສາການກາຍພັນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພະຍາດ;ທ່ານ​ສາ​ມາດ​ນໍາ​ໃຊ້ SNP allele ການ​ປ່ຽນ​ແປງ​ຄວາມ​ຖີ່​ຫຼື​ອັດ​ຕາ heterozygous ແລະ​ຕົວ​ຊີ້​ວັດ​ອື່ນໆ​ເພື່ອ​ກໍາ​ນົດ​ພາກ​ພື້ນ​ທີ່​ເລືອກ​ກ່ຽວ​ກັບ genome ... ແລະ​ອື່ນໆ, ລວມ​ກັບ​ການ​ພັດ​ທະ​ນາ​ຂອງ​ການ​ລໍາ​ດັບ​ຜ່ານ​ສູງ​, ຫຼາຍ​ຮ້ອຍ​ພັນ​ຫຼື​ຫຼາຍ​ກວ່າ​ສະ​ຖານ​ທີ່ SNP ສາ​ມາດ​ໄດ້​ຮັບ​ຈາກ​ຊຸດ​ຂອງ​ຂໍ້​ມູນ​ລໍາ​ດັບ​.ມັນສາມາດເວົ້າໄດ້ວ່າ SNP ໄດ້ກາຍເປັນພື້ນຖານຂອງການຄົ້ນຄວ້າທາງພັນທຸກໍາຂອງປະຊາກອນ.

ແນ່ນອນ, ການປ່ຽນແປງຂອງພື້ນຖານໃນ genome ບໍ່ແມ່ນການທົດແທນພື້ນຖານຫນຶ່ງກັບຖານອື່ນ (ເຖິງແມ່ນວ່ານີ້ແມ່ນທົ່ວໄປທີ່ສຸດ).ມັນກໍ່ເປັນໄປໄດ້ວ່າມີຖານຫນຶ່ງຫຼືຈໍານວນຫນ້ອຍຫນຶ່ງຫາຍໄປ, ຫຼືສອງຖານ.ພື້ນ​ຖານ​ອື່ນໆ​ຈໍາ​ນວນ​ຫນຶ່ງ​ໄດ້​ຖືກ​ໃສ່​ໃນ​ກາງ​.ລະດັບການແຊກ ແລະ ການລຶບຂະໜາດນ້ອຍນີ້ແມ່ນລວມກັນເອີ້ນວ່າ InDel (ການແຊກ ແລະ ການລຶບ), ເຊິ່ງໝາຍເຖິງສະເພາະການແຊກ ແລະ ການລຶບຊິ້ນສ່ວນສັ້ນ (ໜຶ່ງ ຫຼືຫຼາຍຖານ).InDel ທີ່ເກີດຂື້ນຢູ່ສະຖານທີ່ຂອງ gene ອາດຈະມີຜົນກະທົບຕໍ່ການເຮັດວຽກຂອງ gene, ດັ່ງນັ້ນບາງຄັ້ງ InDel ອາດຈະມີບົດບາດສໍາຄັນໃນການຄົ້ນຄວ້າ.ແຕ່ໂດຍລວມແລ້ວ, ສະຖານະພາບຂອງ SNP ເປັນພື້ນຖານຂອງພັນທຸກໍາຂອງປະຊາກອນແມ່ນຍັງບໍ່ສາມາດປ່ຽນແປງໄດ້.